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"Un gentil microbe" by Raphaelle*

Microbes, Genomics and Bioinformatics

The apparent simplicity of microbes hides a surprising genetic diversity and evolutionary plasticity. Microbes causing infectious diseases, which can survive in a wide variety of environments (animal hosts, human hosts, nature) are a great example. Using Genomics and Bioinformatics we are interested in host-pathogens interactions, factors influencing the emergence of pathogens and the flux of  pathogenicity genes. [More ...]

Keywords: Genomics, Transcriptomics,  Metagenomics, Bioinformatics, Biodiversity,  Environmental Metagenomics, Disease Ecology, One Health, Translational research, Clinical Metagenomics, Genomic epidemiology, AntiMicrobial Resistance, Genome Assembly, Functional Annotation, Complex Genomes

Microbes, Génomique et Bioinformatique

La simplicité apparente des microbes cache en fait une diversité génétique et une plasticité évolutive surprenantes. Les microbes causant les maladies infectieuses qui survivent dans une grande variété d'environnements (hôte animal, hôte humain, nature) en sont une excellente illustration. À l'aide d'outils génomiques et bio-informatiques, nous nous intéressons aux interactions hôtes-pathogènes, aux factors influençant l'émergence de pathogènes, et aux flux des gènes de pathogénicité dans l'environnement. [En savoir plus ...]

Mots-clés: Génomique, Transcriptomique, Métagénomique, Bio-informatique, Biodiversité, Métagénomique environnementale, Ecologie des Maladies (infectieuses), Une seule Santé, Recherche translationnelle, Métagénomique clinique, Épidémiologie génomique, Résistance aux anti-microbiens, Assemblage de génomes, Annotation fonctionnelle, Génomes complexes
* A nice microbe, as imagined by my 5-years old daughter. It lost -what seems to be- flagella and pili along the years. I long to find this little beast to sequence its genome. If by any chance you stumble upon it, let me know!  Un gentil microbe, selon ma fille de 5 ans. Il a perdu -ce qui semble être- des flagelles et des pili au cours des années. J'ai bien hâte de trouver cette petite bête pour séquencer son génome. Si par hasard vous tombez dessus, laissez moi savoir !

Contact

Sandrine Moreira
Genomic and Bioinformatic laboratory lead
Public Health Laboratory of Quebec / Laboratoire de Santé Publique du Québec (LSPQ)
Associate Professor
Department of Biochemistry, Université de Montréal
sandrine.moreira@umontreal.ca

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